Khoản phải thu (nộp thừa) khi nộp phí tác động tiêu cực đến môi trường. Khấu trừ? Hoàn lại? Quên đi? Thấu hiểu? Bỏ qua?

Trong bối cảnh hiện nay, khi mức phí tác động tiêu cực dự kiến tăng và các cơ quan giám sát đang tăng cường kiểm tra trên nhiều lĩnh vực, vấn đề quản lý hiệu quả phí tác động tiêu cực đến môi trường (NVOS) ngày càng trở nên cấp thiết.

Các nguyên tắc cơ bản về việc nộp phí tác động tiêu cực đến môi trường được quy định tại Điều 16.4 Luật Liên bang số 7-FZ ngày 10/01/2002 (sửa đổi ngày 26/12/2024) "Về bảo vệ môi trường", thủ tục khấu trừ và hoàn trả phí được quy định bởi Lệnh của Cơ quan Giám sát Tài nguyên Thiên nhiên Liên bang (Rosprirodnadzor) số 334 ngày 20/06/2019. Nhìn chung, có thể nói hệ thống nộp và quản lý phí hiện tại đã tồn tại và liên tục thay đổi kể từ năm 2016.

Có vẻ như lĩnh vực này đang phát triển và được quản lý tốt... nhưng! Vấn đề nộp tiền tạm ứng lại trở thành một trở ngại lớn. Các cơ sở sử dụng tài nguyên thiên nhiên có quy trình sản xuất "không đồng đều", đang mở rộng sản xuất hoặc thực hiện các biện pháp nâng cao hiệu quả và giảm thiểu tác động tiêu cực – chắc chắn sẽ phải đối mặt với nhu cầu khấu trừ hoặc hoàn lại số tiền nộp thừa từ các khoản tạm ứng phí NVOS. Trong một số trường hợp, con số này lên tới hàng trăm triệu rúp.

Khi thảo luận về khía cạnh này trong mối quan hệ giữa các tổ chức kinh tế và cơ quan giám sát, không thể không nhắc đến việc trước ngày 27/12/2019, tất cả chúng ta chỉ có một phương thức duy nhất để nộp tạm ứng hàng quý – 1/4 số tiền được tính cho năm trước. Điều này hiển nhiên đã tạo ra những khoản nộp thừa khổng lồ đối với một số tổ chức. Trong khi đó, thủ tục khấu trừ và hoàn trả chỉ được phê duyệt vào ngày 20/06/2019. Thêm vào đó là thời gian cần thiết để cơ quan quản lý phí thử nghiệm các quy trình, cùng với thời hạn xem xét các tài liệu thực thi chính, dẫn đến rủi ro không thể thu hồi vốn.

Thực tiễn xét xử hiện nay đã phản ánh rõ điều này. Một trong những ví dụ điển hình là phán quyết của tòa án trong vụ án số A33-27628/2024 ngày 14/10/2025, trong đó cơ sở sử dụng tài nguyên thiên nhiên bị từ chối hoàn trả số tiền tạm ứng nộp thừa lên tới 93 triệu rúp.

Thêm về thực tiễn xét xử (Thông tin được trích từ kênh Telegram "Promecolog"):

"Theo một vụ án, việc Cục RPN không hành động trong việc khấu trừ, hoàn trả 136 triệu rúp đã được công nhận là hợp pháp, do Công ty đã bỏ lỡ thời hiệu khởi kiện 3 năm đối với các yêu cầu (liên quan đến giai đoạn 2016-2020, Công ty đã nộp đơn vào năm 2021, 2022 nhưng chỉ khởi kiện ra tòa vào năm 2023)"

"Trong một vụ án khác, RPN lại là bên thua kiện: cũng do bỏ lỡ thời hiệu khởi kiện, các yêu cầu truy thu 80 triệu rúp đã bị tuyên là bất hợp pháp."

"Trường hợp đáng kinh ngạc nhất mà chúng tôi gặp gần đây là việc RPN đã thu hồi thành công gần 400 triệu rúp vào năm 2025 do không thực hiện kế hoạch giảm xả thải trong giai đoạn 2016-2017. Tòa án chỉ ra rằng khi vi phạm việc thực hiện kế hoạch, thời hiệu áp dụng là 20 năm, đánh đồng điều này với việc gây thiệt hại cho nguồn nước."

Từ năm 2020, chúng ta có 3 phương án nộp tiền tạm ứng:

• 1/4 số tiền tính cho năm trước
• 1/4 định mức được thiết lập (Nếu có)
• dựa trên dữ liệu thực tế của kiểm soát môi trường sản xuất (PEK).

Toàn bộ hệ thống tính toán, báo cáo và quản lý phí là một lĩnh vực riêng biệt trong công tác môi trường, và không thể mô tả hết mọi sự phức tạp chỉ trong một bài viết. Tuy nhiên, tôi muốn nêu ra các mốc thời gian chính và những điểm tựa then chốt để bạn có thể hành động một cách tự tin:

• việc khấu trừ và hoàn trả được thực hiện trong cùng một Mã phân loại ngân sách (KBK) và Mã phân loại lãnh thổ (OKTMO);
• thời hiệu khởi kiện để hoàn trả tiền nộp thừa là 3 năm. Ngày bắt đầu tính từ ngày trên ủy nhiệm chi;
• thời hạn quy định để Rosprirodnadzor xem xét biên bản đối chiếu là 30 ngày;
• thời hạn quy định để xem xét đơn yêu cầu khấu trừ/hoàn trả số tiền nộp thừa là 3 tháng;
• thời hạn quy định để xem xét tờ khai phí NVOS là 11 tháng.

Cần lưu ý rằng tổng thời gian cho ba quy trình mang tính hành chính này đã vượt quá 1 năm, chiếm hơn 1/3 thời hiệu khởi kiện.

Từ những kinh nghiệm thành công và thất bại trong lĩnh vực này, dưới đây là những thực tiễn và lời khuyên hữu ích:

• Phương thức nộp tạm ứng với mức 1/4 có những nhược điểm đáng kể, tốt hơn hết nên chọn nộp tạm ứng theo dữ liệu PEK.
• Bạn có cơ hội đánh giá và chọn phương thức có lợi nhất 1 lần mỗi năm – "trước" và "trong quá trình" nộp tờ khai phí. Đối với mỗi loại tác động tiêu cực, nên so sánh cả 3 phương thức nộp tạm ứng dựa trên dữ liệu sản xuất và chọn phương thức có lợi nhất.
• Nếu không có sự đối thoại mang tính xây dựng với cơ quan quản lý phí – hãy mạnh dạn khởi kiện ra tòa để yêu cầu khấu trừ/hoàn trả. Hiện nay, các quan chức của cơ quan giám sát có xu hướng không chịu trách nhiệm về các quyết định, mà chuyển quy trình này sang lĩnh vực quyết định của tòa án.
• Nếu có sự chênh lệch giữa KBK hoặc OKTMO trong các khoản thanh toán – hãy gửi thông báo làm rõ chi tiết ủy nhiệm chi, "chuyển đổi" các khoản thanh toán giữa các thông tin khác nhau và tiến hành khấu trừ (chỉ áp dụng trong cùng một pháp nhân). RPN có thể từ chối, nhưng thực tế, khả năng này vẫn tồn tại khi có sự phối hợp giữa RPN và Kho bạc.
• Biên bản đối chiếu – nên thực hiện sau mỗi lần thanh toán hoặc tính phí (lên đến 6 lần một năm). Luôn có sẵn biên bản đối chiếu cập nhật.
• Tạo cơ sở dữ liệu thanh toán, bao gồm: Dữ liệu tờ khai phí NVOS, Dữ liệu kế toán, Dữ liệu của cơ quan quản lý phí. Dữ liệu ban đầu của kế toán và RPN nên được lập dựa trên bảng cân đối số phát sinh. Cần tính đến tất cả các thuộc tính – số tiền, ngày ủy nhiệm chi, loại tờ khai (lần đầu/điều chỉnh), kỳ tính phí, OKTMO, KBK, v.v. Đối chiếu cả ba nguồn dữ liệu theo dòng thời gian, sự phụ thuộc vào cơ sở có tác động tiêu cực (ONVOS), kỳ thanh toán và kỳ báo cáo.
• Kinh nghiệm cho thấy, tại một số cơ quan quản lý lãnh thổ của RPN, có thực tiễn chấp nhận khấu trừ tiền nộp thừa NVOS vượt quá thời hiệu 3 năm, nhưng không áp dụng cho việc hoàn trả.
• Loại bỏ việc tính toán bằng bảng tính Excel. Triển khai và sử dụng các phần mềm môi trường đã được kiểm chứng. (Bạn có thể xem đánh giá và nguyên tắc lựa chọn trong các tài liệu của tình huống thực tế mà tôi đã trình bày khi tham gia bảng xếp hạng TOP-100).

Và cầu mong sức mạnh sẽ ở bên bạn!